Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRC1Q96M27 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms