Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP47Q96K76 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms