Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK5RAP3Q96JB5 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms