Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIC2Q96JB3 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms