Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COG3Q96JB2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms