Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
BICD1Q96G01 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BICD1Q96G01 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
BICD1Q96G01 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
BICD1Q96G01 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BICD1Q96G01 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BICD1Q96G01 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BICD1Q96G01 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BICD1Q96G01 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BICD1Q96G01 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BICD1Q96G01 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BICD1Q96G01 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BICD1Q96G01 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
BICD1Q96G01 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
BICD1Q96G01 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
BICD1Q96G01 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BICD1Q96G01 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms