Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms