Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms