Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF183Q96D59 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms