Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms