Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMIGD2Q96BF3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms