Protein–RNA interactions for Protein: Q92922

SMARCC1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCC1Q92922 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCC1Q92922 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms