Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRAT1Q92837 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms