Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRUQ92729 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms