Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOBEC4Q8WW27 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC4Q8WW27 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms