Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBY8

PMFBP1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMFBP1Q8TBY8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PMFBP1Q8TBY8 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms