Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMIEQ8NEW7 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIEQ8NEW7 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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