Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PIK3C3Q8NEB9 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PIK3C3Q8NEB9 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms