Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCG5

CHST4, Carbohydrate sulfotransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST4Q8NCG5 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST4Q8NCG5 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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