Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTL3Q8N8U3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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