Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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