Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV73

FGD6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD6Q6ZV73 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FGD6Q6ZV73 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms