Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00299Q6ZSB3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms