Protein–RNA interactions for Protein: Q6V0L0

CYP26C1, Cytochrome P450 26C1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP26C1Q6V0L0 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP26C1Q6V0L0 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP26C1Q6V0L0 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP26C1Q6V0L0 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP26C1Q6V0L0 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP26C1Q6V0L0 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP26C1Q6V0L0 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP26C1Q6V0L0 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP26C1Q6V0L0 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP26C1Q6V0L0 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP26C1Q6V0L0 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP26C1Q6V0L0 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP26C1Q6V0L0 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP26C1Q6V0L0 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP26C1Q6V0L0 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP26C1Q6V0L0 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP26C1Q6V0L0 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP26C1Q6V0L0 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP26C1Q6V0L0 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP26C1Q6V0L0 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP26C1Q6V0L0 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP26C1Q6V0L0 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP26C1Q6V0L0 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP26C1Q6V0L0 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP26C1Q6V0L0 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP26C1Q6V0L0 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP26C1Q6V0L0 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP26C1Q6V0L0 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP26C1Q6V0L0 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP26C1Q6V0L0 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP26C1Q6V0L0 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP26C1Q6V0L0 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYP26C1Q6V0L0 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYP26C1Q6V0L0 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYP26C1Q6V0L0 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYP26C1Q6V0L0 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYP26C1Q6V0L0 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYP26C1Q6V0L0 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYP26C1Q6V0L0 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYP26C1Q6V0L0 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYP26C1Q6V0L0 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP26C1Q6V0L0 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP26C1Q6V0L0 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP26C1Q6V0L0 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP26C1Q6V0L0 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP26C1Q6V0L0 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP26C1Q6V0L0 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP26C1Q6V0L0 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP26C1Q6V0L0 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP26C1Q6V0L0 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP26C1Q6V0L0 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP26C1Q6V0L0 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP26C1Q6V0L0 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP26C1Q6V0L0 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP26C1Q6V0L0 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP26C1Q6V0L0 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP26C1Q6V0L0 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP26C1Q6V0L0 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP26C1Q6V0L0 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP26C1Q6V0L0 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP26C1Q6V0L0 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP26C1Q6V0L0 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP26C1Q6V0L0 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP26C1Q6V0L0 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP26C1Q6V0L0 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP26C1Q6V0L0 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP26C1Q6V0L0 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP26C1Q6V0L0 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP26C1Q6V0L0 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP26C1Q6V0L0 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP26C1Q6V0L0 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP26C1Q6V0L0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP26C1Q6V0L0 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP26C1Q6V0L0 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP26C1Q6V0L0 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP26C1Q6V0L0 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP26C1Q6V0L0 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP26C1Q6V0L0 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP26C1Q6V0L0 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP26C1Q6V0L0 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP26C1Q6V0L0 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP26C1Q6V0L0 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP26C1Q6V0L0 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP26C1Q6V0L0 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP26C1Q6V0L0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP26C1Q6V0L0 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP26C1Q6V0L0 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP26C1Q6V0L0 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP26C1Q6V0L0 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP26C1Q6V0L0 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP26C1Q6V0L0 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP26C1Q6V0L0 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP26C1Q6V0L0 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP26C1Q6V0L0 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP26C1Q6V0L0 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP26C1Q6V0L0 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP26C1Q6V0L0 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP26C1Q6V0L0 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP26C1Q6V0L0 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP26C1Q6V0L0 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms