Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX73

C16orf89, UPF0764 protein C16orf89, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf89Q6UX73 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C16orf89Q6UX73 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms