Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU7

CASC1, Protein CASC1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC1Q6TDU7 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASC1Q6TDU7 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASC1Q6TDU7 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASC1Q6TDU7 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASC1Q6TDU7 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASC1Q6TDU7 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASC1Q6TDU7 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASC1Q6TDU7 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASC1Q6TDU7 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASC1Q6TDU7 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASC1Q6TDU7 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASC1Q6TDU7 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASC1Q6TDU7 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASC1Q6TDU7 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASC1Q6TDU7 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASC1Q6TDU7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASC1Q6TDU7 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CASC1Q6TDU7 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASC1Q6TDU7 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASC1Q6TDU7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASC1Q6TDU7 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CASC1Q6TDU7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASC1Q6TDU7 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASC1Q6TDU7 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASC1Q6TDU7 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASC1Q6TDU7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms