Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRAF7Q6Q0C0 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF7Q6Q0C0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms