Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD54Q6NXT1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms