Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms