Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q5VSD8 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q5VSD8 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Q5VSD8 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Q5VSD8 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q5VSD8 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Q5VSD8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q5VSD8 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q5VSD8 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q5VSD8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q5VSD8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q5VSD8 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q5VSD8 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q5VSD8 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q5VSD8 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q5VSD8 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q5VSD8 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q5VSD8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q5VSD8 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q5VSD8 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Q5VSD8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q5VSD8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q5VSD8 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q5VSD8 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q5VSD8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q5VSD8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Q5VSD8 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q5VSD8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Q5VSD8 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q5VSD8 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q5VSD8 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Q5VSD8 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Q5VSD8 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Q5VSD8 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Q5VSD8 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q5VSD8 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q5VSD8 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Q5VSD8 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q5VSD8 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Q5VSD8 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Q5VSD8 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Q5VSD8 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Q5VSD8 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Q5VSD8 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Q5VSD8 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Q5VSD8 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Q5VSD8 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Q5VSD8 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Q5VSD8 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC11□□□□□ -0.65
Q5VSD8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Q5VSD8 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q5VSD8 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q5VSD8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q5VSD8 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q5VSD8 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q5VSD8 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q5VSD8 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q5VSD8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Q5VSD8 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q5VSD8 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Q5VSD8 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Q5VSD8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q5VSD8 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Q5VSD8 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Q5VSD8 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Q5VSD8 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Q5VSD8 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q5VSD8 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q5VSD8 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Q5VSD8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q5VSD8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q5VSD8 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q5VSD8 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q5VSD8 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q5VSD8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q5VSD8 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q5VSD8 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q5VSD8 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q5VSD8 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q5VSD8 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q5VSD8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q5VSD8 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q5VSD8 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q5VSD8 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q5VSD8 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q5VSD8 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q5VSD8 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q5VSD8 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q5VSD8 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Q5VSD8 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Q5VSD8 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q5VSD8 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q5VSD8 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q5VSD8 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q5VSD8 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q5VSD8 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q5VSD8 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q5VSD8 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q5VSD8 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q5VSD8 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms