Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF58

IFFO2, Intermediate filament family orphan 2, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO2Q5TF58 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFFO2Q5TF58 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFFO2Q5TF58 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFFO2Q5TF58 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFFO2Q5TF58 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFFO2Q5TF58 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFFO2Q5TF58 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFFO2Q5TF58 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFFO2Q5TF58 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFFO2Q5TF58 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFFO2Q5TF58 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFFO2Q5TF58 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFFO2Q5TF58 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFFO2Q5TF58 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFFO2Q5TF58 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFFO2Q5TF58 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFFO2Q5TF58 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFFO2Q5TF58 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFFO2Q5TF58 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFFO2Q5TF58 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFFO2Q5TF58 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFFO2Q5TF58 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFFO2Q5TF58 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFFO2Q5TF58 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFFO2Q5TF58 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFFO2Q5TF58 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
IFFO2Q5TF58 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFFO2Q5TF58 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFFO2Q5TF58 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFFO2Q5TF58 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFFO2Q5TF58 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFFO2Q5TF58 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFFO2Q5TF58 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFFO2Q5TF58 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
IFFO2Q5TF58 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFFO2Q5TF58 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFFO2Q5TF58 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFFO2Q5TF58 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFFO2Q5TF58 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFFO2Q5TF58 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFFO2Q5TF58 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFFO2Q5TF58 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFFO2Q5TF58 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFFO2Q5TF58 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFFO2Q5TF58 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFFO2Q5TF58 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFFO2Q5TF58 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFFO2Q5TF58 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
IFFO2Q5TF58 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFFO2Q5TF58 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFFO2Q5TF58 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
IFFO2Q5TF58 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFFO2Q5TF58 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFFO2Q5TF58 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFFO2Q5TF58 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFFO2Q5TF58 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFFO2Q5TF58 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFFO2Q5TF58 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFFO2Q5TF58 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFFO2Q5TF58 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFFO2Q5TF58 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IFFO2Q5TF58 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFFO2Q5TF58 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFFO2Q5TF58 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFFO2Q5TF58 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFFO2Q5TF58 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFFO2Q5TF58 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFFO2Q5TF58 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFFO2Q5TF58 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFFO2Q5TF58 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFFO2Q5TF58 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFFO2Q5TF58 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IFFO2Q5TF58 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFFO2Q5TF58 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFFO2Q5TF58 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFFO2Q5TF58 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFFO2Q5TF58 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFFO2Q5TF58 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFFO2Q5TF58 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFFO2Q5TF58 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFFO2Q5TF58 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFFO2Q5TF58 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFFO2Q5TF58 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFFO2Q5TF58 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IFFO2Q5TF58 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFFO2Q5TF58 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFFO2Q5TF58 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFFO2Q5TF58 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFFO2Q5TF58 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFFO2Q5TF58 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFFO2Q5TF58 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFFO2Q5TF58 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFFO2Q5TF58 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFFO2Q5TF58 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFFO2Q5TF58 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFFO2Q5TF58 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFFO2Q5TF58 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFFO2Q5TF58 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFFO2Q5TF58 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFFO2Q5TF58 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms