Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHYHD1Q5SRE7 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms