Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms