Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUW0

KRBOX4, KRAB domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBOX4Q5JUW0 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRBOX4Q5JUW0 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRBOX4Q5JUW0 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRBOX4Q5JUW0 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRBOX4Q5JUW0 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBOX4Q5JUW0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms