Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms