Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ODF2Q5BJF6 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms