Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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RPL39P5Q59GN2 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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RPL39P5Q59GN2 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPL39P5Q59GN2 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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RPL39P5Q59GN2 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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RPL39P5Q59GN2 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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