Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms