Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HSD17B12Q53GQ0 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms