Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NBPF1Q3BBV0 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms