Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TWISTNBQ3B726 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms