Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL38Q2WGJ6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms