Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SPHKAPQ2M3C7 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
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