Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKIDA1Q1XH10 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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