Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IMPG1Q17R60 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
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