Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCK2Q16822 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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