Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC18A3Q16572 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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