Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSRP2Q16527 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSRP2Q16527 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSRP2Q16527 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSRP2Q16527 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSRP2Q16527 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSRP2Q16527 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSRP2Q16527 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSRP2Q16527 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSRP2Q16527 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSRP2Q16527 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSRP2Q16527 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSRP2Q16527 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSRP2Q16527 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSRP2Q16527 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSRP2Q16527 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSRP2Q16527 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSRP2Q16527 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSRP2Q16527 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSRP2Q16527 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSRP2Q16527 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSRP2Q16527 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSRP2Q16527 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSRP2Q16527 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSRP2Q16527 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CSRP2Q16527 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSRP2Q16527 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSRP2Q16527 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSRP2Q16527 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CSRP2Q16527 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSRP2Q16527 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSRP2Q16527 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSRP2Q16527 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSRP2Q16527 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSRP2Q16527 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms