Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TWIST1Q15672 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TWIST1Q15672 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TWIST1Q15672 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TWIST1Q15672 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TWIST1Q15672 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TWIST1Q15672 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TWIST1Q15672 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TWIST1Q15672 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TWIST1Q15672 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TWIST1Q15672 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TWIST1Q15672 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TWIST1Q15672 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TWIST1Q15672 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TWIST1Q15672 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TWIST1Q15672 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TWIST1Q15672 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TWIST1Q15672 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TWIST1Q15672 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TWIST1Q15672 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TWIST1Q15672 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TWIST1Q15672 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TWIST1Q15672 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TWIST1Q15672 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TWIST1Q15672 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TWIST1Q15672 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TWIST1Q15672 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TWIST1Q15672 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TWIST1Q15672 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TWIST1Q15672 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TWIST1Q15672 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TWIST1Q15672 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TWIST1Q15672 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TWIST1Q15672 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TWIST1Q15672 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TWIST1Q15672 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TWIST1Q15672 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TWIST1Q15672 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TWIST1Q15672 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TWIST1Q15672 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TWIST1Q15672 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TWIST1Q15672 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TWIST1Q15672 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TWIST1Q15672 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TWIST1Q15672 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TWIST1Q15672 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TWIST1Q15672 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TWIST1Q15672 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TWIST1Q15672 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TWIST1Q15672 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TWIST1Q15672 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TWIST1Q15672 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TWIST1Q15672 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TWIST1Q15672 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TWIST1Q15672 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TWIST1Q15672 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TWIST1Q15672 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TWIST1Q15672 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TWIST1Q15672 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TWIST1Q15672 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TWIST1Q15672 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TWIST1Q15672 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TWIST1Q15672 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TWIST1Q15672 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TWIST1Q15672 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TWIST1Q15672 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TWIST1Q15672 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TWIST1Q15672 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms