Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRADDQ15628 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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